本文介绍来自MD Anderson Cancer Center的Alexandre Reuben团队发表在Nature Machine Intelligence上的文章Deep learning-based prediction of the T cell receptor–antigen binding specificity。在本篇文章中,作者构建了一个pMHC-TCR结合预测网络(pMTnet),该模型基于迁移学习,用来预测新生抗原(neoantigens)和T细胞受体(T-cell receptors, TCRs)结合特异性。作者把pMTnet用于人类肿瘤序列数据并进行了一系列观察。总的来说,pMTnet解决了长期存在的TCR-pMHC配对预测问题,揭示了基因组规模的生物观点,它也可以作为生物标记的基础用于预测免疫反应。
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