日前,来自中国上海的天壤 X-Lab 团队,其自研的蛋白质结构计算平台TRFold2,在基于国际权威的CASP14蛋白质测试集的评估中获得82.7的成绩(满分100),超过华盛顿大学生物学家 David Baker 团队研发的 RoseTTAFold,仅次于AlphaFold2。

同时,对比 AlphaFold2 的 128 个 TPUv3 核心(相当于 256 块 GPU)算力配比,天壤的算法训练仅用 8 张 RTX3090。在预测约 400 个氨基酸的蛋白链时,AlphaFold2 需要 70 多秒;TRFold 16 秒即可完成,而且还是在只用一张 GPU 的情况下。

图示:参加CASP14比赛团队的部分成绩排名。

这个成绩是目前国内所有公开蛋白质结构预测模型中取得的最好成绩,它标志着我国计算生物学领域的表现已经处于世界第一梯队。

面对团队取得的阶段性进展,天壤创始人薛贵荣博士表示:「我们通过两年半的时间掌握了蛋白质折叠预测的核心技术,并以此参与到国际最前沿的生物医学领域的应用中,希望能够开辟出一条 AI 生物学的应用之路。」

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