
12月16日,《Science》杂志公布了2021年的年度科学突破榜单,AlphaFold 和 RoseTTA-fold 两种基于人工智能预测蛋白质结构的技术位列榜首。
近日,我国科学家在该研究领域亦取得突破。复旦大学马剑鹏教授团队与上海人工智能实验室合作,以《OPUS-Rota4: 一个基于梯度和深度学习的蛋白质侧链建模框架》(“OPUS-Rota4: agradient-based protein side-chain modeling framework assisted by deeplearning-based predictors”)[1]为题在《生物信息学简报》(Briefings in Bioinformatics)上发表论文,展示了OPUS-Rota4蛋白质侧链预测算法,其对侧链结构的预测精度比AlphaFold2高出13%。

在目前AlphaFold算法开源的情况下,OPUS-Rota4可以为任何蛋白质结构预测工作提供比AlphaFold更准确的侧链模型,从而为蛋白质结构研究,尤其是基于蛋白结构的新药设计工作提供了利器。
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