结构生物信息学缺乏连接生物结构和机器学习方法的接口，使得现代神经网络架构的应用变得十分困难。这对基于结构的生物信息学方法的发展，产生了负面影响，是结构生物学研究的瓶颈之一。
在这里，来自 VIB-KU Leuven 脑与疾病研究中心 Switch 实验室的研究人员，展示了 PyUUL——这是一个将生物结构转换为 3D 张量的数据库，支持「开箱即用」般地应用最先进的深度学习算法。
该库将生物大分子转换为计算机视觉典型的数据结构，例如体素和点云，已经对其进行了广泛的机器学习研究。此外，PyUUL 支持开箱即用的 GPU 和稀疏计算。研究人员已经使用 PyUUL 解决了一些典型的生物信息学问题，例如结构识别和对接。
该研究以「PyUUL provides an interface between biological structures and deep learning algorithms」为题，于 2022 年 2 月 18 日发布在《Nature Communications》。
论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-022-28327-3

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