2022年3月23日,来自哥伦比亚大学的Artem Cherkasov和英伟达的Abraham C等人在Nature Machine Intelligence杂志发表文章,全面阐述了GPU计算和深度学习的历史趋势和最新进展,并讨论了它们对药物发现的直接影响。

论文链接:
https://www.nature.com/articles/s42256-022-00463-x
摘要
深度学习几乎颠覆了每一个研究领域,包括那些对药物发现有直接重要性的领域,如药物化学和药理学。这场革命在很大程度上归功于高度可并行的GPU的空前进步和支持GPU的算法的发展。在这篇文章中,我们全面介绍了GPU算法的历史趋势和最新进展,并讨论了它们对发现新药和药物靶点的直接影响。我们还介绍了最先进的深度学习架构,这些架构在早期药物发现和随后的hit-to-lead阶段都有实际应用,包括加速分子对接、评估脱靶效应和预测药理特性。最后,我们讨论了GPU加速和深度学习模型对药物发现领域的全球民主化的影响,这可能会推动对不断扩大的化学世界的有效探索,以加速发现新药。
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