本文介绍由xingang peng等人发表于ICML上的文章：Pocket2Mol: Efficient Molecular Sampling Based on 3D Protein Pockets。作者提出了一种新的可以满足口袋施加的多个几何约束的采样方法：Pocket2Mol，这是一个由两个模块组成的 E(3)-等变生成网络，它不仅可以捕获结合口袋原子之间的空间和键合关系，还可以在不依赖 马尔科夫链蒙特卡洛方法（MCMC）的情况下从易于处理的分布中以口袋表示为条件对新候选药物进行采样。实验结果表明，从 Pocket2Mol 中取样的分子具有明显更好的结合亲和力和其他药物特性，例如药物相似性和合成可及性。

论文链接：https://arxiv.org/pdf/2205.07249v1.pdf

 

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