引起儿童流行性肠胃炎的 A 组和 C 组轮状病毒中刺突蛋白 VP4 的 VP8* 结构域表现出保守的半乳凝素样折叠,用于在细胞进入过程中识别聚糖。在 B 组轮状病毒中,它在成人中引起严重的腹泻暴发,VP8* 结构域 (VP8*B) 令人惊讶地与 A 组或 C 组轮状病毒的 VP8* 缺乏序列相似性。
贝勒医学院的研究人员,通过使用最近开发的 AlphaFold2 进行从头算结构预测,并通过确定 1.3-Å 晶体结构来验证预测模型,表明 VP8*B 表现出不同于半乳凝素折叠的新结构。
这种具有 β-折叠夹住 α-螺旋的折叠代表了基于聚糖阵列筛选的聚糖识别的新折叠,这表明 VP8*B 识别含有 N-乙酰乳糖胺部分的聚糖。尽管不明显,但该研究说明了进化如何在同一病毒属的同源蛋白中结合结构上不同的折叠具有相似的功能。
该研究以「Novel fold of rotavirus glycan-binding domain predicted by AlphaFold2 and determined by X-ray crystallography」为题,于 2022 年 5 月 5 日发布在《Communications Biology》。
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