今天给大家介绍一篇中南大学曹东升教授的研究团队发表在Briefings in Bioinformatics上的一篇文章《ABC-Net: a divide-and-conquer based deep learning architecture for SMILES recognition from molecular images》。该论文主要利用计算机视觉中目标检测的框架,对分子图像进行分子检测,同时预测原子和键的性质。经过实验验证,该方法优于baselines,在光学化学结构识别任务(optical chemical structure recognition ,OCSR)上性能优异。
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该方法的整体流程如上图所示。不难发现,方法整体思路是将分子图像输入到ABC-Net中,之后下采样获得原子和键的位置热图,同时根据对应习得的表示进行若干性质预测,最后根据热图对分子图的结构进行重构,同时得到分子表示(如SMILES、ECFP等)进行相关指标计算。
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