必需蛋白质对于细胞的发育和存活是必不可少的。必需蛋白的鉴定不仅有助于了解细胞存活的最低要求，而且在疾病诊断、药物设计和医疗等方面都具有现实意义。

随着蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）数据的快速积累，通过计算从蛋白质-蛋白质相互作用网络（PIN）中识别必需蛋白质变得越来越流行。到目前为止，已经开发了多种基于 PIN 的必需蛋白质鉴定方法，但效果参差不齐。

复旦大学的研究人员提出了一种新方法，称为 iMEPP，通过融合多种类型的生物数据并将影响最大化机制应用于 PIN，从 PIN 中识别必需蛋白质。

研究人员首先整合 PPI 数据、基因表达数据和基因本体来构建加权 PIN，以减轻原始 PPI 数据中高假阳性的影响。然后，他们用正交数据和 PIN 拓扑信息定义 PIN 中节点的影响分数。以此为基础，他们开发了一种影响折扣算法，来识别基于影响最大化机制的必需蛋白质。研究表明，该方法可从酿酒酵母 PIN 中鉴定必需蛋白质。

该研究以「Identifying essential proteins from protein–protein interaction networks based on influence maximization」为题，于 2022 年 8 月 16 日发布在《BMC Bioinformatics》。

图片

论文链接：https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-022-04874-w

内容中包含的图片若涉及版权问题，请及时与我们联系删除