近日,Mila 唐建团队联合英伟达、英特尔、IBM 以及蛋白质设计初创公司百奥几何共同开源了蛋白质机器学习平台 TorchProtein。TorchProtein 在此前开源平台 TorchDrug 的基础上,为蛋白质打造了一套专用的模块组件。TorchProtein 不仅提供了处理蛋白质的数据结构、主流的算法模型,还包括了标准数据集和任务评测接口。其所有接口均有很强的可扩展性,满足各类机器学习算法开发的需要。无论是图机器学习、蛋白质语言模型还是自监督训练,都能轻松基于 TorchProtein 实现。

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基于 TorchProtein 的相关研究:
GearNet(https://arxiv.org/abs/2203.06125)
PEER Benchmark (https://arxiv.org/abs/2206.02096)
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