语言模型可直接生成3D的XYZ、CIF和PDB文件，用于生成分子、材料和蛋白质结合位点

Language models can generate molecules, materials, and protein binding sites directly in three dimensions as XYZ, CIF, and PDB files

语言模型可以直接生成3D的XYZ、CIF和PDB文件，用于生成分子、材料和蛋白质结合位点

要点:

动机：传统的分子设计方法只针对可以用图表达的有机分子等简单结构，而材料和生物分子等复杂结构需要更完整的表示方法，本文旨在展示如何用语言模型直接在3D空间生成分子、材料和蛋白质结合位点等结构.
方法：使用基于Transformer的语言模型，直接在3D空间中生成分子、材料和蛋白质结合位点的XYZ、CIF和PDB文件.
优势：使用语言模型直接在3D空间中生成结构，不需要将它们转换为线性串表示，能处理不同分布的化学结构，包括大型生物分子，且表现与目前领先的基于图和基于点云的3D生成模型相当.

使用语言模型直接在3D空间生成分子、材料和蛋白质结合位点的XYZ、CIF和PDB文件，展示了语言模型在处理复杂化学结构上的强大能力，为逆向设计分子和材料提供了巨大潜力。