药物开发的成本在增加，但是投资回报在减少。从新分子实体（NME）的数量来看，美国食品及药物管理局批准的药物数量正在下降。其中的原因包括许多潜在化合物的不良副作用和效率降低。这既是制药业面临的问题，也是那些无药可治或少药可治的疾病患者面临的问题。

计算化学、计算机科学、结构生物学和分子生物学的进步都有助于改进药物设计策略，缩短药物发现所需的时间。通过将化学信息学和生物信息学与系统生物学相结合，我们可以创造出一种强大的工具，用于了解病理生理系统的机制，并确定治疗各种疾病的先导分子。这种药物设计方法的整合还可以在预测药物作用和副作用并使之合理化、提高药物的安全性和有效性以及提高批准率方面发挥关键作用。

针对人们对药物发现的各种计算工具的基本方面缺乏了解的问题，本书汇集了最新的生物信息学和化学信息学方法，以及这些方法与系统生物学的整合。本书主要面向化学和生物信息学领域的研究人员和学者，也可作为高年级学生的有用资源。