


Q:您能分享一些关于Recursion从细胞绘制(cell painting)到明场成像技术( bright-field imaging )转变的细节吗?
Chris Gibson:此前我们一直在使用这种称为细胞绘制(cell painting)
的技术,即我们对任何细胞类型的细胞器进行染色,以提取形态特征。
几年前,一位成员来找我说,“我们认为所有信息都存在于明场数据中”。当时我看了这些图片,对此表示怀疑。
事实证明,当我们开始探索这一点并构建强大的数据集和训练模型时,它的信息并不完全相同,但信息数量和信息质量大致相同。因此,我们能够在明场图像上训练计算机视觉算法,这些图像与我们从细胞绘制方法中获得的性能相匹配。
这对我们来说是一个了不起的转折点,因为明场像的特别之处在于你可以随着时间的推移进行活细胞成像,我们认为这对训练因果模型非常有帮助。
因此,到明年年中,我们在 Recursion 的几乎所有实验都将以这种方式完成,我们将拍摄多个时间点的明场图像。我们还刚刚将转录组学转移到 1536 孔板中,这意味着我们将能够从我们使用明场成像的同一孔中提取转录组学特征。
如今,当我们成像时,还做了一个用于转录组学的复制板,这要昂贵得多,而且从数据的角度来看有点嘈杂。
我们为这项技术感到兴奋。这就是我们认为未来将是多模式的。它以更少的成本获得更多的数据,这始终是我们从 Recursion 中推动的。






Q:您有什么值得分享的短语吗?
Chris Gibson:我不知道这是否是我赖以生存的一句话,但它很接近:缺乏决定就是一个决定。我经常看到有人害怕做出选择,不选择就是做出选择。
我的联合创始人black和我就决策进行了大量辩论,我们从不害怕做出决定。我们不需要所有的数据来做出决定,除非在非常有限的情况下无法推翻。在可以逆转决定的情况下,人们将从决定中获得很多信息。我看到很多创始人,尤其是技术创始人,都在等待确定性中挣扎。
—The End—
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