5月7日,业内知名风投Flagship Pioneering推出一家病毒蛋白质组学企业Prologue Medicines

这家由Flagship于2021年创立的公司,沉淀三年后首次亮相,拿下5000万美元的旗舰资金。

这笔初始基金将用于推进DELVE ™平台的开发,这是一种蛋白质组辅助药物发现技术平台,旨在利用高通量方法在病毒蛋白质组中搜索潜在的治疗分子。

让病毒为人类而工作


这家初创公司提出一种违反直觉的设想:让病毒为人类工作,而不是与人类为敌。


病毒感染人体后的主要目标是繁殖和传播。


然而病毒没有细胞结构,无法合成自己复制所需的蛋白质,它们必须利用宿主细胞自带的系统来生产蛋白。


以流感病毒为例,通过一种叫做“cap-snatching”的方法,病毒能从宿主的mRNA处“抢夺下”5′端的帽状结构,贴在自己的mRNA前。



为此,病毒在感染过程中会合成许多蛋白质,来逃避免疫系统或欺骗其他细胞成为“病毒工厂”,让它们生产病毒的关键蛋白。


Prologue在宣传时提出了一个利用巨细胞病毒产生与人类细胞因子IL-10相关的蛋白质来治疗关节炎的例子,以证明这些新合成的蛋白质可能是有益的。


基于几十年前的零散观察,他们认为这些病毒所合成的蛋白质可以被重新利用,甚至可能具有药物研发的潜力。


那么要如何找到合适的蛋白质?DELVE ™平台给出的答案是人工智能算法高通量生物学


该平台包含目前全球已知最大的病毒蛋白结构数据库,约有620万种病毒蛋白。


其中既有来自已知人类蛋白质的详细数据,也有通过Prologue专有计算框架预测的以前未表征的病毒蛋白的注释。


通过将大量生物数据与机器学习技术相结合,Prologue能不断挖掘、不断扩展其病毒蛋白质组规模。


再利用公共和专有的大型语言模型来预测病毒蛋白的功能,揭示病毒蛋白及其独特特征。


最终评估它们调节人类生理学以治疗疾病的潜力,来发现全新的药物。


布局免疫代谢 核心高管团队


据悉Prologu最初将专注于癌症、代谢和免疫学适应症,这一选择与他们高管团队的背景紧密结合。


联合创始人兼首席执行官是在Flagship孵化企业中有丰富任职经验的Lovisa Afzelius博士。



除了Prologue外同时担任tRNA疗法明星公司 Alltrna、防病毒变异药物企业Apriori Bio以及利用自然进化开发新药的 Metaphore Biotechnologies的联合创始人兼首席执行官。


并且Lovisa曾在辉瑞和阿斯利康等大型制药公司任职,拥有 20 年的制药经验,在建立自身免疫药物方面具有丰富的临床管理经验。


Prologue 的创始首席科学官Hozefa Bandukwala博士,同样在免疫代谢药物上资历深厚。



Hozefa博士曾在辉瑞免疫代谢实验室任职,过去任糖尿病细胞疗法公司Sigilon Therapeutics的副总裁,该公司在2023年被礼来以3400万美元收购。


同时,他也是与罗氏达成近 8 亿美元的独家合作的免疫代谢领域新锐Rheos Medicines的高级总监兼发现生物学负责人。


顶级风投重押 生物数据有多值钱?

Flagship非常看重AI+蛋白质组学在生物医药的巨大潜力。

早在创立 Prologue 之前,他们就已经孵化了AI+蛋白质组学企业ProFound Therapeutics


这家初创公司于2022年悄悄启动,大胆地声称已经发现了数以万计以前未知的人类蛋白质,这些蛋白质可能构成新药或靶点的基础。

Flagship为此耐心孵化了两年,并豪爽地投入了7500万美元

如今再次入局蛋白质组学,或许是在他们眼中,AI+蛋白质组学市场化的时机已经成熟。

一方面,蛋白质新工具的接连涌现让蛋白质研究的难度和成本显著降低,高通量质谱技术的出现推动了蛋白质组学的发展,带来了海量的数据。

另一方面,人工智能与机器学习的进步,使企业有能力快速表征和选择那些能够精确调节人体生理学的蛋白质,以无可挑剔的精度创造强大的新药。

并且近年来,蛋白质组学经历了兴趣和投资的激增。

全球首批领先的蛋白质组学公司已陆续上市。

包括美国的Quantum-Si和Seer公司以及瑞典的Olink公司,其中Olink在2023年被赛默飞以31亿美元重金收购,溢价高达74%。

在国内也有西湖欧米和珞米生命这样的蛋白质组学领先企业,商业模式正从单一的技术或设备提供商,转向综合性健康解决方案供应商。

而ProFound的意义则在于,业界开始把目光投向了人体之外,进入病毒蛋白质组这个相对未知的领域。

ProFound 和 Prologue 这样的AI+蛋白质组学企业只是最近Flagship更广泛趋势的一部分,这些公司都拥有一个共同点 —— 探索生物数据的可能性。

即为从自然界中搜索大型化学、遗传或蛋白质数据集,以寻找药物的起点。

2023年获得5000万美元融资的Empress Therapeutics正在搜索微生物DNA以寻找小分子药物的线索,目前已拥有15种先导化合物,预计2年内递交多个IND。


与Prologue 拥有同样首席执行官的Metaphore Biotechnologies曾表示,它正在模仿自然来寻找药物,该公司在今年五月获得了5000万美元的投资。

拿下5000万美元A轮融资的Montai Health则提出了“Anthromolecule(天然食源分子)”的概念,旨在从食品、草药和补充剂中的分子中寻找药物。


正如Prologue的创始总裁兼Flagship的高级负责人Theonie Anastassiadis所说:

“生物数据与机器学习技术的结合,正在解决历史上我们无法解决的事情。”

相信AI与生命科学的结合将是下一个创造奇迹的领域。


—The End—

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