近日,天壤 XLab 发布蛋白质结构预测平台 TRFold,其最新版本的预测精度接近 AlphaFold2,达到世界领先水平。
此外,TRFold 突破了 AlphaFold2 需要超大算力的瓶颈,采取权重共享的方式节约算力,预测绝大多数蛋白质链所需时间不超过 16 秒,以更小算力、更高效率推动 AI+生命科学的应用发展。
TRFold 基于 CASP14 蛋白质测试集的评估数据
绿色:真实结构,蓝色:预测结构
天壤 XLab 基于第十四届国际蛋白质结构预测竞赛(CASP14)的蛋白质测试集进行企业内测,TRFold 取得 82.7 分(TM-Score,评估蛋白质结构拓扑相似性的指标),已超过 Baker Lab 在 GitHub 公布的 RoseTTAFold 预测结果的 81.3 分,仅次于 AlphaFold2 的 91.1 分。
TRFold 采取权重共享的方式以节约算力,在训练时,AlphaFold2 使用了 128 个 TPUv3 核心(约等于 256 张 GPU),TRFold 仅使用了 8 张 Nvidia RTX 3090 GPU,以极小算力取得接近 AlphaFold2 的成绩。
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