- 简介本研究旨在通过将MR图像、临床和分子病理数据整合到基于transformer的深度学习模型中,解决数据异质性和性能泛化性问题,从而改善胶质母细胞瘤的生存预测。我们提出并评估了一种基于transformer的非线性和非比例生存预测模型。该模型采用自监督学习技术,有效地编码高维MRI输入,使用交叉注意力与非成像数据进行整合。为了展示模型的泛化性,我们使用时间相关的一致性指数(Cdt)在两个训练设置中评估模型,使用三个独立的公共测试集:UPenn-GBM、UCSF-PDGM和RHUH-GBM。结果表明,所提出的transformer模型在成像和非成像数据方面均取得了良好的表现,有效地整合了两种模态以提高性能(UPenn-GBM测试集,成像Cdt为0.645,多模态Cdt为0.707),同时优于最先进的基于3D-CNN的后融合模型。在三个独立的多中心测试集中观察到了一致的性能,Cdt值分别为0.707(UPenn-GBM,内部测试集)、0.672(UCSF-PDGM,第一个外部测试集)和0.618(RHUH-GBM,第二个外部测试集)。该模型在所有三个数据集中实现了有利和不利生存患者的显著区分(logrank p值分别为1.9×10^-8、9.7×10^-3和1.2×10^-2)。总之,所提出的基于transformer的生存预测模型整合了来自不同输入模态的互补信息,相对于最先进的方法,有助于改善胶质母细胞瘤的生存预测。在不同机构中观察到了一致的性能,支持模型的泛化性。
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- 图表
- 解决问题本论文旨在通过将MRI图像、临床和分子病理数据集成到基于transformer的深度学习模型中,解决胶质母细胞瘤患者的生存预测问题。
- 关键思路本文提出了一种基于transformer的非线性、非比例生存预测模型,通过自监督学习技术对高维MRI输入进行编码,并使用交叉注意力将其与非成像数据进行整合。该模型在三个独立的公共测试集上进行评估,证明了其泛化性能。
- 其它亮点本文提出的transformer模型在成像和非成像数据上均表现出色,有效整合了两种模态以提高性能,并在三个独立的多中心测试集中表现出一致的性能。实验结果证明了模型的泛化性能和有效性。
- 最近的相关研究包括使用3D-CNN的late-fusion模型和其他基于深度学习的模型。
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