Wasserstein Flow Matching: Generative modeling over families of distributions

2024年11月01日
  • 简介
    生成模型通常关注于通过学习(即回归)简单的概率流,将单一的源分布传输到单一的目标分布。然而,在现代数据驱动领域,如计算机图形学和单细胞基因组学中,数据集中的样本(例如点云)本身可以被视为分布(例如离散测度)。在这种情况下,标准的生成模型范式——流匹配,会忽略样本的相关几何结构。为了解决这一问题,我们提出了*Wasserstein流匹配*(WFM),该方法通过利用Wasserstein几何的黎曼性质,将流匹配适当地扩展到分布族上。我们的算法利用了(熵正则化)最优传输理论和计算方面的最新进展,以及神经网络架构中的注意力机制。我们提出了两个新颖的算法贡献。首先,我们展示了如何对高斯分布进行生成建模,从单细胞基因组学数据生成颗粒状细胞状态的表示。其次,我们展示了WFM可以学习高维和可变大小点云之间的流,并从空间转录组学数据集中合成细胞微环境。代码可在 [WassersteinFlowMatching](https://github.com/DoronHav/WassersteinFlowMatching) 获取。
  • 图表
  • 解决问题
    该论文旨在解决标准生成模型在处理现代数据驱动领域(如计算机图形学和单细胞基因组学)中的点云样本时,忽略了样本本身作为分布所具有的几何特性的问题。这是一个相对较新的问题,因为随着数据类型的多样化,如何有效利用样本的内在结构成为了一个重要的研究方向。
  • 关键思路
    论文提出了一种名为Wasserstein流匹配(WFM)的新方法,通过利用Wasserstein几何的Riemannian性质,将流匹配提升到分布族上。这种方法不仅考虑了样本之间的距离,还考虑了样本分布的几何结构,从而更好地捕捉数据的本质特征。与传统的生成模型相比,WFM能够更准确地建模复杂的数据分布。
  • 其它亮点
    论文的主要亮点包括:1) 在高维和可变大小的点云之间学习流,能够合成细胞微环境;2) 通过生成高斯分布来表示单细胞基因组数据中的细胞状态;3) 实验设计合理,使用了单细胞基因组学和空间转录组学数据集进行验证;4) 开源代码已发布,便于其他研究人员复现和扩展研究。未来可以进一步探索WFM在更多类型数据上的应用,以及与其他生成模型的结合。
  • 相关研究
    近期在这个领域的一些相关研究包括:1) 'Sinkhorn Divergences for Unsupervised Point Cloud Registration',提出了利用Sinkhorn散度进行无监督点云配准的方法;2) 'Optimal Transport for Domain Adaptation',探讨了最优传输在域适应中的应用;3) 'Generative Adversarial Networks for Point Clouds',研究了生成对抗网络在点云生成中的应用。这些研究都为WFM的发展提供了理论基础和技术支持。
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