Equivariant Flow Matching with Hybrid Probability Transport

2023年12月12日
  • 简介
    这段摘要介绍了生成3D分子的过程,需要同时决定分类特征(原子类型)和连续特征(原子坐标)。深度生成模型,特别是扩散模型(DMs),已经证明在生成具有丰富特征的几何结构方面是有效的。然而,现有的DMs通常受到不稳定的概率动态和低效的采样速度的影响。因此,本文介绍了几何流匹配,它具有等变建模和稳定概率动态的优点。具体来说,我们提出了一种混合概率路径,其中坐标概率路径通过等变最优传输进行规范化,并对不同模态之间的信息进行了对齐。实验结果表明,所提出的方法在多个分子生成基准测试中均能实现更好的性能,并平均提高了4.75倍的采样速度。
  • 图表
  • 解决问题
    论文旨在解决生成3D分子的问题,同时考虑原子类型和原子坐标,现有的深度生成模型存在概率动态不稳定和采样速度低效的问题。
  • 关键思路
    论文提出了几何流匹配的方法,它结合了等变建模和稳定概率动态的优势。具体来说,论文提出了一个混合概率路径,其中坐标概率路径通过等变最优传输进行正则化,并对不同模态之间的信息进行了对齐。
  • 其它亮点
    论文在多个分子生成基准测试中始终实现更好的性能,并平均提高了4.75倍的采样速度。实验使用了哪些数据集,开源代码等信息未提及。
  • 相关研究
    最近在这个领域中,还有一些相关的研究,例如:1)MolGAN:An implicit generative model for small molecular graphs;2)GraphAF: A Flow-Based Autoregressive Model for Molecular Graph Generation;3)Constrained Graph Variational Autoencoders for Molecule Design。
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