F2FLDM: Latent Diffusion Models with Histopathology Pre-Trained Embeddings for Unpaired Frozen Section to FFPE Translation

2024年04月19日
  • 简介
    本研究旨在解决快速冰冻切片技术(Frozen Section,FS)在制备过程中常常会引入褶皱和冰晶效应等伪影和畸变,而高质量的福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-Fixed Paraffin-Embedded,FFPE)切片则需要2-3天的制备时间,但不会出现这些伪影和畸变的问题。虽然基于生成对抗网络(Generative Adversarial Network,GAN)的方法已经被用于将FS转换为FFPE图像(F2F),但是这些方法可能会在转换过程中保留FS伪影或引入新的伪影,从而降低了这些转换图像的临床诊断质量。本研究基于GAN和潜在扩散模型(Latent Diffusion Models,LDM)等最新生成模型,旨在克服这些限制。本研究提出了一种新的方法,将LDM与组织病理学预训练嵌入相结合,以增强FS图像的恢复。我们的框架利用LDM受文本和预训练嵌入的条件控制,学习FS和FFPE组织病理学图像的有意义特征。通过扩散和去噪技术,我们的方法不仅保留了重要的诊断属性,如染色和组织形态,还提出了一种嵌入式翻译机制,以更好地预测输入FS图像的目标FFPE表示。结果,本研究在分类性能方面取得了显著的提高,曲线下面积从81.99%提高到94.64%,同时具有有利的CaseFD。这项研究为FS到FFPE图像转换质量建立了新的基准,有望提高组织病理学FS图像分析的可靠性和准确性。我们的工作可在https://minhmanho.github.io/f2f_ldm/上获得。
  • 作者讲解
  • 图表
  • 解决问题
    如何提高冰冻切片(FS)图像转换为甲醛固定石蜡包埋(FFPE)图像的质量,使其更适合临床评估?
  • 关键思路
    将LDMs与组织病理学预训练嵌入相结合,通过扩散和去噪技术来提高FS图像的恢复能力,同时提出了一种嵌入式转换机制来更好地预测目标FFPE表示。
  • 其它亮点
    论文使用GAN和LDM等模型来进行FS到FFPE图像的转换,并提出了一种新的方法,将LDM与组织病理学预训练嵌入相结合,以提高转换质量。实验结果表明,这种方法能够显著提高分类性能,AUC从81.99%提高到94.64%。
  • 相关研究
    最近的相关研究包括使用GAN进行图像转换,以及使用LDMs进行图像去噪和扩散。
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