MRSegmentator: Robust Multi-Modality Segmentation of 40 Classes in MRI and CT Sequences

2024年05月10日
  • 简介
    目的:介绍一种深度学习模型,能够在MRI扫描中进行多器官分割,从而解决MRI分析中分辨率、标准化强度值和序列变异等方面的挑战。 材料和方法:该模型在英国生物库的1,200个手动注释的MRI扫描、221个内部MRI扫描和1228个CT扫描上进行了训练,利用了从CT分割模型中的跨模态迁移学习。采用人机交互式注释工作流程,以高效地创建高质量的分割。使用Dice相似系数(DSC)和Hausdorff距离(HD)来评估分割精度。该模型将开源。 结果:该模型在分割明确定义的器官方面表现出高精度,对于右肺和左肺的Dice相似系数(DSC)得分为0.97,对于心脏的DSC为0.95。它还展示了在肝脏(DSC:0.96)和肾脏(DSC:左0.95,右0.95)等更具变异性的器官中的稳健性。然而,对于像门静脉和脾静脉(DSC:0.54)以及肾上腺(DSC:左0.65,右0.61)这样的较小和复杂结构的分割,需要进一步优化模型。 结论:所提出的模型是MRI和CT图像中40个解剖结构精确分割的强大工具。通过利用跨模态学习和交互式注释,该模型实现了强大的性能和广泛适用性,成为研究人员和临床医生的有价值资源。它是开源的,可以从https://github.com/hhaentze/MRSegmentator下载。
  • 图表
  • 解决问题
    深度学习模型在MRI扫描中的多器官分割问题
  • 关键思路
    使用交叉模态转移学习和人机交互注释,提出一种新的深度学习模型,可以准确地对MRI和CT图像中的40个解剖结构进行分割。
  • 其它亮点
    该模型在UK Biobank、NAKO和AMOS22数据集上进行了测试,表现出高精度和鲁棒性。同时,该模型是开源的,可以从https://github.com/hhaentze/MRSegmentator下载。
  • 相关研究
    最近的相关研究包括“基于深度学习的医学图像分割”和“多器官分割的自动化方法:回顾和现状”。
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