Benchmarking mortality risk prediction from electrocardiograms

2024年06月24日
  • 简介
    最近有几项高影响力的研究利用大型医院拥有的心电图(ECG)数据库建模和预测患者死亡率。MIMIC-IV是于2023年9月发布的第一个可比较的公共数据集,包括来自美国医院系统的800,000个ECG。此前,最大的公共ECG数据集是Code-15,其中包含巴西例行护理期间收集的345,000个ECG。这些数据集现在为更广泛的观众探索ECG生存建模提供了极好的资源。在这里,我们使用两种神经网络架构对Code-15和MIMIC-IV进行生存模型性能基准测试,比较了四种深度生存建模方法与基于分类器输出训练的Cox回归,并在一到十年内评估了性能。我们的结果产生了AUROC和一致性得分,与过去的工作相当(约为0.8),并且考虑到与死亡率相关的ECG样本比例(MIMIC-IV:27%,Code-15:4%),具有合理的AUPRC得分(MIMIC-IV:0.4-0.5,Code-15:0.05-0.13)。在对相反数据集进行模型评估时,AUROC和一致性值下降了0.1-0.15,这可能是由于队列差异造成的。所有代码和结果都是公开的。
  • 图表
  • 解决问题
    在大型医院ECG数据库上建立模型,预测患者死亡率
  • 关键思路
    使用深度生存模型对Code-15和MIMIC-IV数据集进行生存模型性能基准测试,并将其与Cox回归进行比较
  • 其它亮点
    使用MIMIC-IV和Code-15数据集进行实验,公开了代码和结果,实验结果表明深度生存模型的性能与之前的工作相当,AUPRC分数合理,模型在不同数据集上的性能有所下降,可能是由于队列差异造成的
  • 相关研究
    最近的相关研究包括利用大型医院ECG数据库进行死亡率预测的高影响力研究,以及利用深度学习方法进行生存分析的其他研究,如“DeepSurv: Personalized Treatment Recommender System Using A Cox Proportional Hazards Deep Neural Network”
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