ADEP: A Novel Approach Based on Discriminator-Enhanced Encoder-Decoder Architecture for Accurate Prediction of Adverse Effects in Polypharmacy

2024年05月31日
  • 简介
    动机:意外的药物相互作用(DDIs)在多药治疗中具有重大风险,强调了需要预测方法。最近计算技术的进步旨在解决这一挑战。 方法:我们介绍ADEP,一种新颖的方法,它集成了鉴别器和编码器-解码器模型,以解决数据稀疏性并增强特征提取。ADEP采用包括多种分类方法在内的三部分模型,以预测多药治疗中的不良反应。 结果:对基准数据集的评估显示,ADEP的表现优于众所周知的方法,如GGI-DDI、SSF-DDI、LSFC、DPSP、GNN-DDI、MSTE、MDF-SA-DDI、NNPS、DDIMDL、Random Forest、K-Nearest-Neighbor、Logistic Regression和Decision Tree。关键指标包括准确度、AUROC、AUPRC、F-score、召回率、精确率、假阴性和假阳性。ADEP在预测多药治疗中的不良反应方面实现了更准确的预测。一项真实数据的案例研究说明了ADEP在识别潜在DDIs和预防不良反应方面的实际应用。 结论:ADEP显著推进了多药治疗不良反应的预测,提供了更高的准确性和可靠性。其创新的架构增强了从稀疏医疗数据中提取特征的能力,提高了药物安全性和患者的治疗效果。 可用性:源代码和数据集可在https://github.com/m0hssn/ADEP上获得。
  • 作者讲解
  • 图表
  • 解决问题
    ADEP论文旨在解决多药物治疗中未预料到的药物相互作用问题,提出了一种新的计算方法,以提高预测准确性。
  • 关键思路
    ADEP采用判别器和编码器-解码器模型相结合的方法,以应对数据稀疏性和提高特征提取能力。它包括多种分类方法,可预测多药物治疗中的不良反应。
  • 其它亮点
    ADEP在基准数据集上的评估表明,其表现优于其他已知方法,并提供了更准确和可靠的预测结果。它的创新架构提高了从稀疏医疗数据中提取特征的能力,有助于提高药物安全和患者预后。论文提供了源代码和数据集。
  • 相关研究
    在这个领域中,最近的相关研究包括GGI-DDI、SSF-DDI、LSFC、DPSP、GNN-DDI、MSTE、MDF-SA-DDI、NNPS、DDIMDL、Random Forest、K-Nearest-Neighbor、Logistic Regression和Decision Tree等方法。
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