Learning to Describe for Predicting Zero-shot Drug-Drug Interactions

2024年03月13日
  • 简介
    药物间的不良相互作用(DDI)可能会损害同时服用药物的有效性,在医疗保健中构成重大挑战。随着新药物的开发不断进行,DDI导致的未知不良影响的潜在风险也越来越受到关注。传统的DDI预测计算方法可能由于缺乏知识而无法捕捉新药物的相互作用。本文提出了一个新的问题设置,即零样本DDI预测,用于处理新药物的情况。利用来自DrugBank和PubChem等在线数据库的文本信息,我们提出了一种创新方法TextDDI,其中包括基于语言模型的DDI预测器和基于强化学习(RL)的信息选择器,使得能够选择简明和相关的文本以进行准确的新药物DDI预测。实证结果显示了所提出方法在多种设置下(包括零样本和少样本DDI预测)的优势,所选文本具有语义相关性。我们的代码和数据可在\url{https://github.com/zhufq00/DDIs-Prediction}上获取。
  • 图表
  • 解决问题
    本文旨在解决药物相互作用(DDIs)对同时使用药物的有效性构成威胁的问题,提出了一种新的零样本DDI预测问题设置,以应对新药物的情况。
  • 关键思路
    本文提出了一种基于语言模型的DDI预测器和基于强化学习的信息选择器的TextDDI方法,以选择简明扼要和相关的文本进行准确的DDI预测。
  • 其它亮点
    实验结果表明,TextDDI方法在零样本和少样本DDI预测等多个方面具有优势,所选的文本具有语义相关性。作者已经公开了代码和数据集。
  • 相关研究
    最近的相关研究包括:1)基于图神经网络的DDI预测方法;2)基于深度学习的DDI预测方法;3)基于知识图谱的DDI预测方法。
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